|
|
Vliv stupně příbuzenské plemenitby na reprodukční výkonnost ovcí plemene Zwartbles
Pospíšil, Jakub
Bakalářská práce je zaměřena na posouzení vlivu stupně příbuzenské plemenitby na reprodukční výkonnost u plemene ovcí Zwartbles. V literární rešerši je uveden stručný popis plemene Zwartbles, jeho historie a užitkovost. Dále obecný popis reprodukce a hodnocení reprodukční výkonnosti. Na závěr se práce zmiňuje o plemenitbě a určení stupně příbuzenské plemenitby. Praktická část bakalářské práce je zaměřena na analýzu vlivu příbuzenské plemenitby na reprodukční výkonnost stáda plemene Zwartbles chovaného na ovčí farmě v Mohelnu v letech 2006 – 2021. Stádo bylo rozděleno podle stupně příbuznosti do čtyř skupin. U bahnic se hodnotilo procento narozených a odstavených mláďat. U jehňat se hodnotil přírůstek, výška nejdelšího bederního svalu a hrudníku (MLLT), výška hřbetního loje, zmasilost, váha jehňat ve sto dnech věku.
|
|
|
Populační a ochranářská genetika rysa ostrovida na okraji Západních Karpat
Stehlíková, Monika
Diplomová práce se zabývá populační a ochranářskou genetikou ryse ostrovida na okraji Západních Karpat, zahrnujícím území Chráněné krajinné oblasti Beskydy na české straně a Chráněné krajinné oblasti Kysuce na slovenské straně (celkem ?1500 km2). Cílem práce bylo s využitím především neinvazivních genetických vzorků vyhodnotit trend vývoje genetické diverzity a početnosti této okrajové rysí subpopulace obývající Moravskoslezské Beskydy, Vsetínské Beskydy a Javorníky za období posledních pěti sezón 2016/17 až 2020/21. Vyhodnoceny byly i příbuzenské vztahy a prostorová aktivita vybraných jedinců. Získané genotypy byly doplněny o již dříve genotypované jedince. Celkem tak bylo za období pěti sezón zachyceno 37 jedinců (12 samic a 25 samců). Odhadovaná průměrná početnost populace činila 14 jedinců a efektivní velikost populace kolísala mezi 3,7 – 7 jedinci. Získané výsledky dokládají postupně se snižující genetickou diverzitu populace a zvyšující se příbuzenské páření, kdy koeficient inbreedingu v poslední sezóně 2020/21 zaznamenal nejvyšší hodnotu FIS= 0,169. Výsledky dále ukazují, že se zde jedinci aktivně rozmnožují, bylo zachyceno minimálně 15 potomků v průběhu sledovaného období, z nichž část se v oblasti usadila a rozmnožila. Prostorová aktivita rysů potvrdila propojenost horských celků i napojení na západokarpatskou populaci, kterou dokládá příchod několika nepříbuzných jedinců. Ve sledovaném období byli také zaznamenání čtyři jedinci, jenž migrovali směrem na západ mimo sledované území, ovšem při této cestě všichni až na jednoho zahynuly při střetu s dopravním prostředkem.
|
|
|
Conservation genetics of Galápagos mockingbirds: from immune genes to genomes
VLČEK, Jakub
In this thesis I have dealt with the population genetic processes of mockingbirds in the Galápagos Islands ( Mimus ) in relation to the limited island area, from the perspective of two types of immune genes and the genome-wide approach. The thesis starts with an introduction to population genetic concepts relevant to conservation genetics followed by description of immune genes: the major histocompatibility complex (MHC) and the Toll-like receptors (TLR). In the final part of the introduction, I address how genetic drift, selection and inbreeding shape genome-wide genetic patterns in small populations. The introduction is followed by four chapters, beginning with an examination of MHCII polymorphism in populations of mockingbirds in the Galápagos Islands. The study of the relationship between MHCII and the abundance of ectoparasites is the content of the second chapter. The third chapter shows how polymorphism of TLRs is shaped by interaction of genetic drift and natural selection. The last chapter deals with the effects of limited island size on inbreeding and genetic load, supported by inferences of the past demography of mockingbirds. The thesis concludes with a summary of the results and their potential implications in the field of conservation genetics.
|
|
|
Možnosti ochrany ex situ vzácných a ohrožených druhů rostlin
Vítová, Jana ; Münzbergová, Zuzana (vedoucí práce) ; Dostálek, Tomáš (oponent)
V bakalářské práci jsou přiblíženy možnosti, význam a možné problémy ex situ ochrany pro budoucí zachování biodiverzity rostlin na Zemi. V úvodní části práce jsou přiblíženy jednotlivé procesy a programy ex situ ochrany. Zároveň jsou poskytnuty informace o mezinárodní spolupráci v oblasti semenných bank a botanických zahrad, které svou činností a vzájemnou spoluprací vytváří záchranné programy pro zajištění co nejvíce vzorků rostlinného materiálu pro případné budoucí použití. V práci jsou zmiňovány i mezinárodní databáze rostlin, jež širší veřejnosti poskytují přesné a podrobné informace o uchovávaném materiálu vzácných a ohrožených druhů rostlin. Dále jsou v práci zmapovány v současné době známé problémy ex situ ochrany s jejich dopady na sběrový a uskladněný materiál. Klíčová slova Ochrana ex situ, ohrožené rostliny, Ministerstvo životního prostředí, databáze, dormance semen, inbreeding, outbreední deprese, kultivace, semenné banky, botanické zahrady, tkáňové kultury, in vitro, genetický drift, mutace, hybridizace, ochrana volně žijících živočichů, ohrožené druhy
|
|
|
Kanaanský pes a využití psa ve vzdělávání
Rutová, Šárka ; Jančaříková, Kateřina (vedoucí práce) ; Pavlasová, Lenka (oponent)
Předmětem diplomové práce je kanaánský pes se zaměřením na využití psa ve vzdělávání. Práce je rozdělena na teoretickou a praktickou část. První část práce čtenáře podrobně seznamuje s plemenem kanaánský pes. Jedná se o vzácné a velmi staré plemeno psa, původem z Izraele. První psi byli importování do Evropy a Ameriky až v 60. letech 20. století. Na našem území se dnes počítá jen s desítkami jedinců. A právě proto, že psů v Evropě není mnoho, je problém s množením tohoto plemene i přenosem genetických nemocí. V praktické části se zabývám vytvořením genealogie kanaánských psů v České republice. Výzkumně jsem se zaměřila na sledování inbreedingu. V druhé části se zabývám využitím psa ve vzdělávání. Praktickým výstupem jsou dva vytvořené výukové programy. První program je zaměřený na poznávání psa. Je určen pro žáky základních škol a je součástí této práce. Výukový program je také vyzkoušen v praxi a jeho vyplněné výsledky jsou součástí přílohy. Žáci se dozví důležité informace o psech, jak se k psovi chovat a porozumět mu, či informace o primitivních plemenech jako je kanaánský pes. Druhý výukový program se zaměřuje na inbreeding a je určený studentům gymnázií. Studenti se v programu dozvědí zajímavosti o inbreedingu a nenáhodném křížení. Součástí programu je též pracovní list a výukový text. Klíčová...
|
|
|
Evoluce domestikace psa a genetická diverzita recentních plemen.
Ungrová, Lenka ; Černá Bolfíková, Barbora (vedoucí práce) ; Vinkler, Michal (oponent)
Místo, datování a průběh prvních fází domestikace jsou nejčastěji zkoumanými tématy při studiu evoluce domestikace psů. Ačkoliv existuje mnoho studií, kolem domestikace a divergence psa od vlka je stále mnoho otazníků. Pozdější fáze domestikace jsou neméně zajímavé. Je známo, že prototypy psích plemen se formovaly mnohem dříve, než vznikaly první chovatelské kluby. Dá se říci, že první selekční tlak byl, kromě krotkosti, také na druh práce, kterou měl pes vykonávat. Druhá fáze selekce již byla na konkrétní fenotypové znaky a často zahrnovala cílené hybridizace mezi vznikajícími plemeny. Za posledních 200 let se tak podařilo vyšlechtit přes 400 psích plemen s jedinečnou kombinací znaků. Tato práce si klade za cíl shrnout poznatky o evoluci psa domácího a zmapovat vznik moderních plemen z genetického hlediska. Práce také shrne, jaké geny a znaky evoluce psa a jeho domestikace ovlivnily a jaký měly vliv na genetickou diverzitu psích plemen.
|
|
|
Inbreeding a jeho vliv na fitness zvířat chovaných v zajetí
Králová, Michala ; Frynta, Daniel (vedoucí práce) ; Komárková, Martina (oponent)
Ztráta habitatu a fragmentace je dnes aktuálním problémem, který vede k nevyhnutelné redukci efektivní velikosti populace u mnoha druhů. Negativní efekt redukce populací umocňují další procesy jako je genetický drift a inbreeding způsobující zhoršení fitness (tj.inbreedingová deprese). Inbreeding a příbuzné fenomény mohou být tedy hrozbou pro přežití zbytkových populací ohrožených druhů zvířat. Negativní vliv inbreedingu na populace držené v zajetí, které jsou součástí různých záchranných programů je ještě aktuálnějším problémem (Frankham et al. 2002, O'Grady 2006). Cílem této práce bylo zhodnotit současnou odbornou literaturu o vlivech inbreedingu na populace ryb, plazů, ptáků a savců. Inbreeding ovlivňuje většinou negativně především vlastnosti spojené s fitness a dále pohlavně selekční znaky a chování.
|
|
|
Genetická variabilita sysla obecného (Spermophilus citellus) v České Republice
Starcová, Magda ; Vohralík, Vladimír (vedoucí práce) ; Kotlík, Petr (oponent)
Sysel obecný (Spermophilus citellus) je podle zákona o ochraně přírody i podle Červeného seznamu kriticky ohroženým druhem. V České republice, která představuje severozápadní okraj jeho areálu rozšíření, se sysel v současnosti vyskytuje na 34 lokalitách, které jsou poměrně malé a vzájemně izolované. Do střední Evropy se tento druh rozšířil v souvislosti s neolitickou deforestací. Disjunktní typ distribuce sysla byl způsoben výrazným poklesem jeho početnosti během druhé poloviny 20. století v důsledku změn polního hospodaření, fragmentace krajiny a dalších faktorů. Lze předpokládat, že tento proces zanechal stopy na genetické struktuře našich populací. Hlavním cílem této práce byla podrobná analýza genetické variability populací sysla obecného na území České republiky a hledání korelací s dostupnými údaji o jeho biologii a demografii. Bylo použito 13 mikrosatelitových lokusů a zpracováno celkem 408 vzorků z 27 lokalit v ČR a 3 vzorky z 1 lokality v Maďarsku jako outgroup. Pomocí různých přístupů byly odhaleny detaily o substruktuře a diferenciaci jednotlivých populací, genetické variabilitě, míře inbreedingu a geografické distribuci genetické variability. Mezi studovanými populacemi byla nalezena signifikantní genetická diferenciace, západo-východní gradient v genetickém složení populací a zóna přechodu mezi...
|
|
|
Genetická struktura lokálních plemen domestikantů
Neradilová, Silvie ; Baranyiová, Eva (vedoucí práce)
Přechod od výhradně loveckého způsobu života k počátkům zemědělství byl zásadním zlomem pro člověka a vývoj civilizace. Tato doba byla příhodná pro domestikační procesy. Prvními domestikanty vůbec byli psi. Jejich chov je spojován s obranou sídel, ale především dobytka, pomáhají také při pastevectví a lovu potravy, a v některých kulturách jsou dodnes sami zdrojem potravy. Nejnovější trendy vedou k šlechtění nových ras a rozdělování původní genetické rozmanitosti do menších uzavřených skupin, kde následně dochází ke zvyšování homozygotnosti a projevu recesivně podmíněných onemocnění. Nejvýrazněji se tyto efekty uplatňují u malých lokálních plemen, které mají malou populační velikost. Globální ochranou genetické diverzity skotu, drůbeže a prasat se již zabývalo mnoho studií, zřejmě z důvodů vysoké ekonomické hodnoty těchto živočichů. Impakt domestikovaných šelem na člověka je však srovnatelný a vzhledem k rostoucímu trhu v oblasti veterinárních služeb je potřeba ochraňovat dostatečnou genetickou variabilitu různých unikátních ras. Cílem zadané práce je srovnat vybraná lokální plemena psů z různých oblastí původu, vyhodnotit jejich celkovou genetickou diverzitu, zjistit výskyt kandidátních typů onemocnění a porovnat jejich frekvenci u těchto plemen. Ze získaných parametrů doporučit vhodné postupy k ochraně genofondu těchto unikátních ras. Bude vybráno středoevropské plemeno (např. Český fousek), subtropické plemeno (např. šarplaninec), tropické kontinentální plemeno (např. Basenji), tropické ostrovní plemeno (např. Novoguinejský zpívající pes). Materiál bude sbírán na výstavách a ve spolupráci s lokálními chovateli. Vzorky budou zpracovány klasickými postupy populační genetiky v laboratoři molekulární genetiky FTZ ČZU.
|
|
|
Populační analýza plemen přežvýkavců zahrnutých do genetických zdrojů v České republice
Benešová, Jaroslava ; Vostrý, Luboš (vedoucí práce) ; Karel, Karel (oponent)
Genetická variabilita vyjadřuje míru rozmanitosti populace plemen hospodářských zvířat a vzhledem ke šlechtitelským cílům může značně klesat. V důsledku snížení genetické variability populace dochází k nepříznivým vlivům či k úplnému zániku plemene. Nepříznivé vlivy se projevují především na fitness zvířat a jejich užitkových vlastnostech. Při dostatečné velikosti populace a při panmiktickém páření jsou tyto vlivy minimální, avšak v populacích, kde dochází k redukci počtu jedinců, jsou tyto vlivy zásadní. V souvislosti s inbreedingem se negativně působící vlivy nazývají inbrední deprese. Míru inbreedingu v populacích je nutné sledovat a na základě toho vytvářet připařovací plány tak, aby byl dosahován co největší genetický zisk při zachování genetické variability, jenž nebude mít negativní vliv na fitness a užitkové vlastnosti.
Populační analýza byla zpracována na základě dat z plemenných knih v letech 1985 až 2013. Data obsahovala rodokmen šumavské ovce, která je zařazena mezi genetické zdroje v České republice. Pomocí programu SAS 9.3 ( Statistical Analysis Software ) byla stanovena hodnota koeficientu inbreedingu pro každého jedince a průměrná hodnota celé populace. Dalšími vyhodnocenými parametry bylo vyhodnocení trendu koeficientu inbreedingu ve sledovaném období a efektivní velikost populace a generační interval pro čtyři cesty přenosu genů a dvě cesty přenosu genů. Trend vývoje koeficientu inbreedingu (Fx) byl vyhodnocen jako kolísavě stoupající s průměrnou hodnotou kolem 0,6%. Průměrný generační interval (L) pro čtyři cesty přenosu genů byl vypočítán 3,83 let a pro dvě cesty přenosu genů 3,55 let. Hodnota generačního intervalu se ve sledovaném období zkracuje, čímž dochází k intenzifikaci genetického zisku. Efektivní velikost populace (Ne) byla odhadnuta dvěma způsoby. Celková efektivní velikost populace (Ne) zohledňující příbuzenské vztahy byla odhadnuta na počet 85 jedinců a efektivní velikost populace zahrnující pouze samce a samice byla odhadnuta na 3070 jedinců. Na základě provedené analýzy koeficientu inbreedingu, generačního intervalu a efektivní velikosti populace je možné šumavskou ovci řadit k plemenům s nízkým stupněm koeficientu inbreedingu a průměrným generačním intervalem. Na základě hodnoty efektivní velikosti populace 85 jedinců může být plemeno šumavské ovce označováno za ohrožené.
|
host ::
RSS.